Oddělení ekologie (Kateřina Sam)
Vedoucí
Laboratoře
- Laboratoř tropické ekologie (Vojtěch Novotný)
- Laboratoř ekologie a evoluce sociálního hmyzu (Petr Klimeš)
- Laboratoř teoretické ekologie (Tomás Augusto Revilla Rimbach)
- Laboratoř ekologie společenstev (Robert Tropek)
- Laboratoř experimentální ekologie (Jan Hrček)
- Laboratoř evoluční ekologie (Martin Volf)
- Laboratoř multitrofických interakcí (Kateřina Sam)
- Laboratoř molekulární ekologie a fylogenetiky (Pável Fortunato Matos Maraví)
- Laboratoř symbiózy hmyzu (Aleš Buček)
- Laboratoř evoluční genetiky (Petr Nguyen)
- Laboratoř ekologie a evoluce hub (Danny Haelewaters)
