- Oddělení molekulární fyziologie a genetiky (Marek Jindra)
-
Oddělení biodiverzity a ochrany přírody (Lukáš Čížek)
- Laboratoř temperátní biodiverzity (Martin Konvička)
- Laboratoř ekologie lesa (Lukáš Čížek)
- Laboratoř aplikované entomologie (Petr Doležal)
- Laboratoř vlivů člověka na vodní ekosystémy (David Boukal)
- Laboratoř biogeografie a diverzifikace (Zdeněk Faltýnek Fric)
- Laboratoř saproxylického hmyzu (Pavel Šebek)
- Laboratoř ekologie a genetiky pro ochranu přírody (Lukáš Drag)
- Laboratoř evoluce a diverzity vodního hmyzu (Pavel Sroka)
- Visegrad Fund
- Oddělení ekologie (Kateřina Sam)
- Sekretariát


