Mgr. David Doležel, Ph.D.

Funkce: Vedoucí laboratoře - Laboratoř molekulární chronobiologie

Kontaktní údaje

Telefon: 420387775239
E-mail: dolezel@entu.cas.cz

Popis

HLAVNÍ VÝZKUMNÉ SMĚRY

Adaptace hmyzu na sezónní změny - diapauza, mechanismy fotoperiodických hodin (na molekulární, anatomické a genetické úrovni), geografická variabilita fotoperiodickýh hodin, Juvenilní hormon - úloha v diapauze a reprodukci.
Pyrrhocoris apterus jako nový modelový organismus hmyzí endokrinologie (neuropeptidy, evoluce neuropeptidových receptorů), reprodukční chování, cirkadiánní rytmy, fylogeografie P. apterus a související geografické adaptace; vývoj metodických postupů ("umlčování" genů metodou RNA interference, genová editace, orgánové kultivace).
Drosophila melanogaster - teplotní kompenzace cikradinánních hodin, cílená mutageneze (CRISP/CAS9)
Evoluce cirkadiánních genů - magnetorecepce; cirkadiánní hodiny prvoků

HLAVNÍ SPOLUPRÁCE

Roger Butlin, University of Sheffield, UK; Projekt: Fylogeografie ruměnice P. apterus,
Christian Wegener, University of Wuerzburg, Německo; Projekt: Neuropeptidy u ruměnice P. apterus
Vladimir Benes, GeneCore, EMBL, Heildeberg, Německo; Projekt: P. apterus - genom a transkriptom
Richard Pokorny, Philipps-University, Marburg, Německo; Projekt: structura a biochemie hmyzích proteinů skupiny CRY/Photolyase
Fernando Noriega, Florida Int. University, USA; Projekt: Juvenilní hormon P. apterus
Christopher Wheat, Stockholm U., Švédsko – Populační genetika a genomika P. apterus (Pool-sequencing)

Školitel doktorandů:

Současní:

Dřívější:

Adam Bajgar (PhD obhájeno - červen 2013 )

Školitel studentů

Současní:

Dřívější:

Marion Sieber (Mgr. obhájeno 2014)
Katka Švehlová (Mgr. obhájeno 2013)
Martina Jonáková (Mgr. obhájeno 2012)
Olga Pecková (Mgr. obhájeno 2012)
Silvie Fexová (Mgr. obhájeno 2010)
Olga Bazalová (Mgr. obhájeno 2010)
Juraj Dobrovodský (Bcl. obhájeno 2012)
Olga Pecková (Bcl. obhájeno2010)
Eva Stehliková (Bcl. obhájeno2010)

Odborný životopis

narozen: 1974; Česká Republika (ČSSR...)

VZDĚLÁNÍ

1994-1997 Bcl. studium, Biologická fakulta Jihočeské univerzity, Č. Budějovice, CZ

1997 tříměsíční pobyt, The University of Arizona (Tucson), USA, laboratoř Prof. Davida Galbraitha,

1997-1999 Mgr studium, Biologická fakulta Jihočeské univerzity, Č. Budějovice, CZ

1999-2003 doktorské studium, Biologická fakulta Jihočeské univerzity, Č. Budějovice, CZ

2004-2007 postdoktorská stáž Fellow, Brandeis U. (laboratoř J. C. Halla), Waltham, MA, USA.

2007-2010 postdoktorská stáž, Entomologický ústav AVČR, Biologické centrum, Č. Budějovice, CZ

2011-2013 výzkumný pracovník, Entomologický ústav AVČR, Biologické centrum, Č. Budějovice, CZ

Since 2013 vedoucí laboratoře, Entomologický ústav AVČR, Biologické centrum, Č. Budějovice, CZ

VÝUKA

Přírodovědecká fakulta Jihočeské univerzity, katedra molekulární biologie, Č. Budějovice, CZ

Metody molekulární biologie (v češtině, třetina semestrálního kurzu): 2009-2011
Pokročilé metody molekulární biologie, kompletní kurz (KMB/603, alternuje CZ-Eng; celosemestrální kurz) 2011- součastnost
Methods of functional genomics (KMB/217, anglicky, garant kurzu)
Cell Regulation and Signaling (KMB/614, anglicky) – přednáška z chronobiologie 2009-2015
Moderní methody chronobiologie 2009-2015
V součastnosti školitel 7 doktorandů a 2 studentů bakalářského programu
vedoucí obhájených prací: 1x PhD, 6x magisterská a 3x bakalářská práce

VYBRANÉ ZVANÉ PŘEDNÁŠKY A PŘEDNÁŠKY NA KONFERENCÍCH

Marie Curie ITN, Jyväskyla, Finland, May 2010: Circadian and Photoperiodic Clock
Marie Curie ITN, Jyväskyla, Finland, May 2010: Molecular tools applied to non-model insects
Institute of Molecular Life Sciences, University of Zurich, April 2012
University of Jyväskyla, Jyväskyla, Finland, November 2012
MPI for Chemical Ecology, Jena, Germany, November 2012
Institute of Physiology, ASCR, Prague, February 2013
Institute of Organic Chemistry and Biochemistry, ASCR, Prague, April 2013
Wuerzburg University, Germany, October 2013
University of Leicester, UK, December 2013
7th International Symposium on Molecular Insect Science, Amsterdam, July 2014
Wageningen, Netherlands, July, 2014
Osaka, Japan, November 2014
Kobe, Japan, November 2014
Tsukuba, Japan, November 2014
NTU, Taiapei, Taiwan, November 2014
University of Sheffield, UK, December 2014
Swansea University, Wales, UK, March 24, 2015
Institute of Organic Chemistry and Biochemistry, ASCR, Prague, October 2015
University of Krakow, Poland, March 2016
Stellenbosch University, Republic of South Africa, April, 2016

PŘEDPOKLÁDANÉ PREZENTACE NA KONFERENCÍCH

Time and Light, Viena, Austria, May 2016 (poster: Circadian clock in protist Chromera velia)
SRBR meeting, Florida, USA, May 2016 (přednáška: Circadian genes, Photoperiodic clock and Diapause in insect, Pyrrhocoris apterus)
International Congress of Entomology, Orlando, USA, September 2016 (přednáška v rámci symposia: Neuro-Endocrine Regulation of Reproduction in Insects)

ČLENSTVÍ V ODBORNÝCH ORGANIZACÍCH

The Society on Research on Biological Rhythms
INsecTIME – partner, European consortium (FP7 program funded) aiming at Insect chronobiology
International Society for Evolutionary Protistology – 1997-2001

PUBLIKAČNÍ ČINNOST

celkem 26 odborných článků (1x zvané review), >500 citací, h-index 14 (Scopus), 13 (WOS)

OBORNÉ PUBLIKACE V PŘÍPRAVĚ

Pivarciova, Provaznik, Vaneckova, Pivarci, Peckova, Bazalova, Wu, Cada, Kment, Kotwica-Rolinska, Dolezel: Unexpected geographic variability of free running period in the linden bug, Pyrrhocoris apterus (under revision)

Publikace

Celkem nalezeno: 34 záznamů
Ditrich T., Janda V., Vaněčková H., Doležel D. (2018) Climatic variation of supercooling point in the linden bug Pyrrhocoris apterus (Heteroptera: Pyrrhocoridae). Insects 9 : article number 144. DOI: 10.3390/insects9040144
Bazalová O., Doležel D. (2017) Daily Activity of the Housefly, Musca domestica, Is Influenced by Temperature Independent of 3' UTR period Gene Splicing G3: Genes, Genomes, Genetics 7 : 2637-2649. DOI: 10.1534/g3.117.042374
Ibrahim E. A. S., Hejníková M., Shaik H. A., Doležel D., Kodrík D. (2017) Adipokinetic hormone activities in insect body infected by entomopathogenic nematode. J. Insect Physiol. 98 : 347-355. DOI: 10.1016/j.jinsphys.2017.02.009
Kotwica-Rolinska J., Pivarčiová L., Vaněčková H., Doležel D. (2017) The role of circadian clock genes in the photoperiodic timer of the linden bug, Pyrrhocoris apterus, during the nymphal stage. Physiological Entomology 42 : 266-273. DOI: 10.1111/phen.12197
Bazalová O., Kvicalova M., Valkova T., Slaby P., Bartos P., Netusil R., Tomanova K., Braeunig P., Lee H., Šauman I., Damulewicz M., Provazník J., Pokorny R., Doležel D., Vacha M. (2016) Cryptochrome 2 mediates directional magnetoreception in cockroaches. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 113 : 1660-1665. DOI: 10.1073/pnas.1518622113
Pivarčiová L., Vaněčková H., Provazník J., Wu C., Pivarči M., Pecková O., Bazalová O., Čada Š., Kment P., Kotwica-Rolinska J., Doležel D. (2016) Unexpected geographic variability of the free running period in the linden bug, Pyrrhocoris apterus. Journal of Biological Rhythms 31 : 568-576. DOI: 10.1177/0748730416671213
Urbanová V., Bazalová O., Vaněčková H., Doležel D. (2016) Photoperiod regulates growth of male accessory glands through juvenile hormone signaling in the linden bug, Pyrrhocoris apterus. Insect Biochemistry and Molecular Biology 70 : 184-190.
Závodská R., Kobelková A., Šauman I., Bazalová O., Doležel D. (2016) Exprese genů biologických hodin v mozku zavíječe moučného (Ephestia kuehniella). Sborník abstraktů z konference 92. Fyziologické dny - konference české a slovenské fyziologické společnosti, 2.-4. února 2016, Přírodovědecká fakulta JU, České Budějovice, pp. 104, ISBN 978-80-7394-563-3
Doležel D. (2015) Photoperiodic time measurement in insects. Current Opinion in Insect Science 7 : 98-103. DOI: 10.1016/j.cois.2014.12.002
Kobelková A., Závodská R., Šauman I., Bazalová O., Doležel D. (2015) Expression of clock genes /period/ and /timeless /in the central nervous system of the Mediterranean flour moth, Ephestia kuehniella Journal of Biological Rhythms 30 : 104-116. DOI: 10.1177/0748730414568430
Poupardin R., Schöttner K., Korbelová J., Provazník J., Doležel D., Pavlinic D., Beneš V., Košťál V. (2015) Early transcriptional events linked to induction of diapause revealed by RNAseq in larvae of drosophilid fly, Chymomyza costata. BMC Genomics 16 : 702. DOI: 10.1186/s12864-015-1907-4
Smýkal V., Bajgar A., Provazník J., Fexová S., Buřičová M., Takaki K., Hodková M., Jindra M., Doležel D. (2014) Juvenile hormone signaling during reproduction and development of the linden bug, Pyrrhocoris apterus. Insect Biochemistry and Molecular Biology 45 : 69-76. DOI: 10.1016/j.ibmb.2013.12.003
Bajgar A., Doležel D., Hodková M. (2013) Endocrine regulation of non-circadian behavior of circadian genes in insect gut. Journal of Insect Physiology 59 : 881-886. DOI: 10.1016/j.jinsphys.2013.06.004
Bajgar A., Jindra M., Doležel D. (2013) Autonomous regulation of the insect gut by circadian genes acting downstream of juvenile hormone signaling. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 110 : 4416-21. DOI: 10.1073/pnas.1217060110
Závodská R., Fexová S., Von Wowern G., Han G., Doležel D., Šauman I. (2012) Is the Sex Communication of Two Pyralid Moths, Plodia interpunctella and Ephestia kuehniella, under Circadian Clock Regulation? Journal of Biological Rhythms 27 : 206-216. DOI: 10.1177/0748730412440689
Kobelková A., Bajgar A., Doležel D. (2010) Functional molecular analysis of a circadian clock gene timeless promoter from the drosophilid fly Chymomyza costata Journal of Biological Rhythms 25 : 399-409. DOI: 10.1177/0748730410385283 Dokumenty ke stažení: Kobelkova 2010 (pdf)
Doležel D., Zdechovanová L., Šauman I., Hodková M. (2008) Endocrine-dependent expression of circadian clock genes in insects. Cell. Mol. Life Sci. 65 : 964-969. DOI: 10.1007/s00018-008-7506-7
Košťál V., Doležel D., Tollarová M. (2008) Dynamism in physiology and gene transcription during reproductive diapause in a heteropteran bug, Pyrrhocoris apterus. J. Insect Physiol. 54 : 77-88.
Codd V., Doležel D., Stehlík J., Piccin A., Garner K., Seth R., Straatman K., Louis E., Costa R., Šauman I., Kyriacou C., Rosato E. (2007) Circadian rhythm gene regulation in the housefly, Musca domestica. Genetics 177 : 1539-1551. DOI: 10.1534/genetics.107.079160 Dokumenty ke stažení: 2007-Genetics (pdf)
Doležel D., Šauman I., Košťál V., Hodková M. (2007) Photoperiodic and food signals control expression pattern of the clock gene, period, in the linden bug, Pyrrhocoris apterus. J. Biol. Rhythms 22 : 335-342. DOI: 10.1177/0748730407303624