Mgr. David Doležel, Ph.D.
Funkce: Vedoucí laboratoře - Laboratoř molekulární chronobiologie
Telefon:
420387775239
E-mail:
dolezel@entu.cas.cz
HLAVNÍ VÝZKUMNÉ SMĚRY
- Adaptace hmyzu na sezónní změny - diapauza, mechanismy fotoperiodických hodin (na molekulární, anatomické a genetické úrovni), geografická variabilita fotoperiodickýh hodin, Juvenilní hormon - úloha v diapauze a reprodukci.
- Pyrrhocoris apterus jako nový modelový organismus hmyzí endokrinologie (neuropeptidy, evoluce neuropeptidových receptorů), reprodukční chování, cirkadiánní rytmy, fylogeografie P. apterus a související geografické adaptace; vývoj metodických postupů ("umlčování" genů metodou RNA interference, genová editace, orgánové kultivace).
- Drosophila melanogaster - teplotní kompenzace cikradinánních hodin, cílená mutageneze (CRISP/CAS9)
- Evoluce cirkadiánních genů - magnetorecepce; cirkadiánní hodiny prvoků
HLAVNÍ SPOLUPRÁCE
- Roger Butlin, University of Sheffield, UK; Projekt: Fylogeografie ruměnice P. apterus,
- Christian Wegener, University of Wuerzburg, Německo; Projekt: Neuropeptidy u ruměnice P. apterus
- Vladimir Benes, GeneCore, EMBL, Heildeberg, Německo; Projekt: P. apterus - genom a transkriptom
- Richard Pokorny, Philipps-University, Marburg, Německo; Projekt: structura a biochemie hmyzích proteinů skupiny CRY/Photolyase
- Fernando Noriega, Florida Int. University, USA; Projekt: Juvenilní hormon P. apterus
- Christopher Wheat, Stockholm U., Švédsko – Populační genetika a genomika P. apterus (Pool-sequencing)
Školitel doktorandů:
Současní:
- Olga Bazalová
- Markéta Hejníková
- Martin Pivarči
- Lenka Pivarčiová (Chodáková)
- Jan Provazník
- Samarjeet Singh
- Bulah Chia-hsiang Wu
Dřívější:
Adam Bajgar (PhD obhájeno - červen 2013 )
Školitel studentů
Současní:
Dřívější:
- Marion Sieber (Mgr. obhájeno 2014)
- Katka Švehlová (Mgr. obhájeno 2013)
- Martina Jonáková (Mgr. obhájeno 2012)
- Olga Pecková (Mgr. obhájeno 2012)
- Silvie Fexová (Mgr. obhájeno 2010)
- Olga Bazalová (Mgr. obhájeno 2010)
- Juraj Dobrovodský (Bcl. obhájeno 2012)
- Olga Pecková (Bcl. obhájeno2010)
- Eva Stehliková (Bcl. obhájeno2010)
narozen: 1974; Česká Republika (ČSSR...)
VZDĚLÁNÍ
1994-1997 Bcl. studium, Biologická fakulta Jihočeské univerzity, Č. Budějovice, CZ
1997 tříměsíční pobyt, The University of Arizona (Tucson), USA, laboratoř Prof. Davida Galbraitha,
1997-1999 Mgr studium, Biologická fakulta Jihočeské univerzity, Č. Budějovice, CZ
1999-2003 doktorské studium, Biologická fakulta Jihočeské univerzity, Č. Budějovice, CZ
2004-2007 postdoktorská stáž Fellow, Brandeis U. (laboratoř J. C. Halla), Waltham, MA, USA.
2007-2010 postdoktorská stáž, Entomologický ústav AVČR, Biologické centrum, Č. Budějovice, CZ
2011-2013 výzkumný pracovník, Entomologický ústav AVČR, Biologické centrum, Č. Budějovice, CZ
Since 2013 vedoucí laboratoře, Entomologický ústav AVČR, Biologické centrum, Č. Budějovice, CZ
VÝUKA
Přírodovědecká fakulta Jihočeské univerzity, katedra molekulární biologie, Č. Budějovice, CZ
- Metody molekulární biologie (v češtině, třetina semestrálního kurzu): 2009-2011
- Pokročilé metody molekulární biologie, kompletní kurz (KMB/603, alternuje CZ-Eng; celosemestrální kurz) 2011- součastnost
- Methods of functional genomics (KMB/217, anglicky, garant kurzu)
- Cell Regulation and Signaling (KMB/614, anglicky) – přednáška z chronobiologie 2009-2015
- Moderní methody chronobiologie 2009-2015
- V součastnosti školitel 7 doktorandů a 2 studentů bakalářského programu
- vedoucí obhájených prací: 1x PhD, 6x magisterská a 3x bakalářská práce
VYBRANÉ ZVANÉ PŘEDNÁŠKY A PŘEDNÁŠKY NA KONFERENCÍCH
- Marie Curie ITN, Jyväskyla, Finland, May 2010: Circadian and Photoperiodic Clock
- Marie Curie ITN, Jyväskyla, Finland, May 2010: Molecular tools applied to non-model insects
- Institute of Molecular Life Sciences, University of Zurich, April 2012
- University of Jyväskyla, Jyväskyla, Finland, November 2012
- MPI for Chemical Ecology, Jena, Germany, November 2012
- Institute of Physiology, ASCR, Prague, February 2013
- Institute of Organic Chemistry and Biochemistry, ASCR, Prague, April 2013
- Wuerzburg University, Germany, October 2013
- University of Leicester, UK, December 2013
- 7th International Symposium on Molecular Insect Science, Amsterdam, July 2014
- Wageningen, Netherlands, July, 2014
- Osaka, Japan, November 2014
- Kobe, Japan, November 2014
- Tsukuba, Japan, November 2014
- NTU, Taiapei, Taiwan, November 2014
- University of Sheffield, UK, December 2014
- Swansea University, Wales, UK, March 24, 2015
- Institute of Organic Chemistry and Biochemistry, ASCR, Prague, October 2015
- University of Krakow, Poland, March 2016
- Stellenbosch University, Republic of South Africa, April, 2016
PŘEDPOKLÁDANÉ PREZENTACE NA KONFERENCÍCH
- Time and Light, Viena, Austria, May 2016 (poster: Circadian clock in protist Chromera velia)
- SRBR meeting, Florida, USA, May 2016 (přednáška: Circadian genes, Photoperiodic clock and Diapause in insect, Pyrrhocoris apterus)
- International Congress of Entomology, Orlando, USA, September 2016 (přednáška v rámci symposia: Neuro-Endocrine Regulation of Reproduction in Insects)
ČLENSTVÍ V ODBORNÝCH ORGANIZACÍCH
- The Society on Research on Biological Rhythms
- INsecTIME – partner, European consortium (FP7 program funded) aiming at Insect chronobiology
- International Society for Evolutionary Protistology – 1997-2001
PUBLIKAČNÍ ČINNOST
celkem 26 odborných článků (1x zvané review), >500 citací, h-index 14 (Scopus), 13 (WOS)
OBORNÉ PUBLIKACE V PŘÍPRAVĚ
Pivarciova, Provaznik, Vaneckova, Pivarci, Peckova, Bazalova, Wu, Cada, Kment, Kotwica-Rolinska, Dolezel: Unexpected geographic variability of free running period in the linden bug, Pyrrhocoris apterus (under revision)
Celkem nalezeno: 34 záznamů
|
---|
Ditrich T., Janda V.,
Vaněčková H., Doležel D. (2018) Climatic variation of supercooling point in the linden bug Pyrrhocoris apterus (Heteroptera: Pyrrhocoridae). Insects
9
: article number 144. DOI: 10.3390/insects9040144 |
Bazalová O., Doležel D. (2017) Daily Activity of the Housefly, Musca domestica, Is Influenced by Temperature Independent of 3' UTR period Gene Splicing G3: Genes, Genomes, Genetics
7
: 2637-2649. DOI: 10.1534/g3.117.042374 |
Ibrahim E. A. S.,
Hejníková M.,
Shaik H. A., Doležel D.,
Kodrík D. (2017) Adipokinetic hormone activities in insect body infected by entomopathogenic nematode. J. Insect Physiol.
98
: 347-355. DOI: 10.1016/j.jinsphys.2017.02.009 |
Kotwica-Rolinska J.,
Pivarčiová L.,
Vaněčková H., Doležel D. (2017) The role of circadian clock genes in the photoperiodic timer of the linden bug, Pyrrhocoris apterus, during the nymphal stage. Physiological Entomology
42
: 266-273. DOI: 10.1111/phen.12197 |
Bazalová O., Kvicalova M., Valkova T., Slaby P., Bartos P., Netusil R., Tomanova K., Braeunig P., Lee H.,
Šauman I., Damulewicz M.,
Provazník J., Pokorny R., Doležel D., Vacha M. (2016) Cryptochrome 2 mediates directional magnetoreception in cockroaches. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
113
: 1660-1665. DOI: 10.1073/pnas.1518622113 |
Pivarčiová L.,
Vaněčková H.,
Provazník J.,
Wu C.,
Pivarči M., Pecková O.,
Bazalová O., Čada Š., Kment P., Kotwica-Rolinska J., Doležel D. (2016) Unexpected geographic variability of the free running period in the linden bug, Pyrrhocoris apterus. Journal of Biological Rhythms
31
: 568-576. DOI: 10.1177/0748730416671213 |
Urbanová V.,
Bazalová O.,
Vaněčková H., Doležel D. (2016) Photoperiod regulates growth of male accessory glands through juvenile hormone signaling in the linden bug, Pyrrhocoris apterus. Insect Biochemistry and Molecular Biology
70
: 184-190. |
Závodská R., Kobelková A., Šauman I., Bazalová O., Doležel D. (2016) Exprese genů biologických hodin v mozku zavíječe moučného (Ephestia kuehniella). Sborník abstraktů z konference 92. Fyziologické dny - konference české a slovenské fyziologické společnosti, 2.-4. února 2016, Přírodovědecká fakulta JU, České Budějovice, pp. 104, ISBN 978-80-7394-563-3 |
Doležel D. (2015) Photoperiodic time measurement in insects. Current Opinion in Insect Science
7
: 98-103. DOI: 10.1016/j.cois.2014.12.002 |
Kobelková A.,
Závodská R.,
Šauman I.,
Bazalová O., Doležel D. (2015) Expression of clock genes /period/ and /timeless /in the central nervous system of the Mediterranean flour moth, Ephestia kuehniella Journal of Biological Rhythms
30
: 104-116. DOI: 10.1177/0748730414568430 |
Poupardin R.,
Schöttner K.,
Korbelová J.,
Provazník J., Doležel D., Pavlinic D., Beneš V.,
Košťál V. (2015) Early transcriptional events linked to induction of diapause revealed by RNAseq in larvae of drosophilid fly, Chymomyza costata. BMC Genomics
16
: 702. DOI: 10.1186/s12864-015-1907-4 |
Smýkal V.,
Bajgar A.,
Provazník J.,
Fexová S.,
Buřičová M.,
Takaki K.,
Hodková M.,
Jindra M., Doležel D. (2014) Juvenile hormone signaling during reproduction and development of the linden bug, Pyrrhocoris apterus. Insect Biochemistry and Molecular Biology
45
: 69-76. DOI: 10.1016/j.ibmb.2013.12.003 |
Bajgar A., Doležel D.,
Hodková M. (2013) Endocrine regulation of non-circadian behavior of circadian genes in insect gut. Journal of Insect Physiology
59
: 881-886. DOI: 10.1016/j.jinsphys.2013.06.004 |
Bajgar A.,
Jindra M., Doležel D. (2013) Autonomous regulation of the insect gut by circadian genes acting downstream of juvenile hormone signaling. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America
110
: 4416-21. DOI: 10.1073/pnas.1217060110 |
Závodská R.,
Fexová S., Von Wowern G., Han G., Doležel D.,
Šauman I. (2012) Is the Sex Communication of Two Pyralid Moths, Plodia interpunctella and Ephestia kuehniella, under Circadian Clock Regulation? Journal of Biological Rhythms
27
: 206-216. DOI: 10.1177/0748730412440689 |
Kobelková A.,
Bajgar A., Doležel D. (2010) Functional molecular analysis of a circadian clock gene timeless promoter from the drosophilid fly Chymomyza costata Journal of Biological Rhythms
25
: 399-409. DOI: 10.1177/0748730410385283 Dokumenty ke stažení: Kobelkova 2010 (pdf) |
Doležel D., Zdechovanová L.,
Šauman I.,
Hodková M. (2008) Endocrine-dependent expression of circadian clock genes in insects. Cell. Mol. Life Sci.
65
: 964-969. DOI: 10.1007/s00018-008-7506-7 |
Košťál V., Doležel D.,
Tollarová M. (2008) Dynamism in physiology and gene transcription during reproductive diapause in a heteropteran bug, Pyrrhocoris apterus. J. Insect Physiol.
54
: 77-88. |
Codd V., Doležel D.,
Stehlík J., Piccin A., Garner K., Seth R., Straatman K., Louis E., Costa R.,
Šauman I., Kyriacou C., Rosato E. (2007) Circadian rhythm gene regulation in the housefly, Musca domestica. Genetics
177
: 1539-1551. DOI: 10.1534/genetics.107.079160 Dokumenty ke stažení: 2007-Genetics (pdf) |
Doležel D.,
Šauman I.,
Košťál V.,
Hodková M. (2007) Photoperiodic and food signals control expression pattern of the clock gene, period, in the linden bug, Pyrrhocoris apterus. J. Biol. Rhythms
22
: 335-342. DOI: 10.1177/0748730407303624 |
